Die Masterarbeit weist die Fähigkeit der Absolventinnen und Absolventen aus, ein Problem aus dem Pflegebereich systematisch und unter Anwendung wissenschaftlicher Methoden und im Projektmanagement bearbeiten zu können. Die Masterarbeit dauert zwei Jahre: im ersten Jahr schreiben die Studierenden einen Forschungsantrag (Proposal), das zweite Jahr ist der Datenerhebung, Analyse und dem Schreiben der Arbeit gewidmet. Die Studierenden werden dabei von zwei Fachexperten/-innen begleitet und beurteilt. Die Themen stammen aus dem Forschungsportfolio des INS. Durch die direkte Relevanz für die Pflegepraxis werden die Masterarbeiten auch in nationalen oder internationalen Zeitschriften und Fachmagazinen veröffentlicht.

Mit der erfolgreich abgeschlossenen Masterarbeit erlangen die Absolventen den Titel Master of Science in Nursing der Medizinischen Fakultät der Universität Basel.

Die Stiftung Pflegewissenschaft Schweiz verleiht einen Preis für die beste Masterarbeit in Pflegewissenschaft der Universität Basel. Die Vergabe des Preises erfolgt im Regelfall jährlich im Rahmen der Graduierungsfeier des Instituts für Pflegewissenschaft der Universität Basel. 

Über die Verleihung des Preises entscheidet eine wissenschaftliche Jury.