Nach ihrem Psychologiestudium an der Universität Freiburg im Breisgau promovierte Yvonne Pfeiffer am Department für Management, Technologie und Ökonomie der ETH Zürich zum Thema Sicherheitskultur und Berichten kritischer Ereignisse in der Medizin. Als Postdoc forschte Yvonne zu Sicherheitstheorien und zum Lernen aus Ereignissen sowohl an der MIT Sloan School of Management (USA) als auch an der ETH Zürich. Von 2016 an hat sie in der Stiftung für Patientensicherheit zu vielfältigen Sicherheitsproblemen in der Gesundheitsversorgung wissenschaftliche Untersuchungen durchgeführt: etwa zum sicheren Umgang mit Hochrisiko-Medikamenten, zu Risiken der Digitalisierung oder Fragen der optimalen Implementierung von Verbesserungen in der alltäglichen Versorgung. Als Leiterin des Bereichs Sicherheit in Organisationen brachte sie in viele Projekte ihr arbeits- und organisationspsychologisches Fachwissen zum Thema Sicherheit ein.

Seit 2023 ist Yvonne Pfeiffer Lehrbeauftragte für die Vorlesung «Patientensicherheit und Qualität» an der medizinischen Fakultät der Universität Basel am Institut für Pflegewissenschaft. Neben verschiedenen Lehrverpflichtungen ist Yvonne Pfeiffer zurzeit als Beraterin tätig.